Во второй половине XIV столетия Армения подверглась новым опустошительным нашествиям. Один из представителей монголо-тюркской знати эмир Тимур, прозванный Ленг (Хромым) Тимуром, в 1370-х годах создал в Средней Азии могущественное государство и за короткое время завоевал ряд стран, в том числе и Восточные районы Армении с близлежащими странами.
Войска Ленг-Тимура (Тамерлана) впервые вторглись в Армению в 1386 г. Повторив свое нашествие на следующий год, а затем в 90-х годах, они разорили почти все области страны. Тимур повсюду проявлял необычайную жестокость: грабил, опустошал села и города, свирепо уничтожал население, не щадя ни женщин, ни детей, ни стариков; пленных насильно угонял в города своего государства, главным образом в Самарканд.
В эти годы обезлюдели многие районы Армении. По поводу разрушения города Себастии, например, очевидец писал: «В лето нынешнее (1400 г.) Тамур-бек завладел городом Севастом (Себастией), который разрушил и разорил; всех перерезал, много женщин и детей полонил, а 3000 человек, которые пускали в него стрелы (т. е. оказали вооруженное сопротивление), закопав в землю, заживо похоронил».
Грозный деспот и завоеватель умер в 1405 г., после чего его государство распалось. Воспользовавшись этим, в Армении и в соседних странах вновь подняли голову кочевые племена кара-Коюнлу и ак-Коюнлу, обосновавшиеся в Малой Азии и Армении еще в конце XIII века. Они часто воевали друг с другом, грабили страну, обирали население. В первой половине XV века (1410-1468 гг.) преобладающее положение в Армении занимали племена кара-Коюнлу, а во второй половине (1468-1502 гг.)-ак-Коюнлу.
С начала XVI века появились турецкие и персидские завоеватели. Турецко-османское военно-феодальное государство, основы которого в конце XIII века заложил на северно-западной окраине Малой Азии Осман-бей, в результате многочисленных походов и войн уже во второй половине XIV века подчинило своей власти ряд стран и государств. В 1453 г. турки-османы захватили столицу Византии Константинополь и окончательно сокрушили Византийскую империю.
Опустошительные походы турецких султанов продолжались и в дальнейшем. В 1502 г. в Иране было основано новое персидское государство, названное Сефевидским, так как его основатель шах-Исмаил происходил из известного в городе Ардебиле рода шейха Сефиад-дина. С 1512 г. между Османской Турцией и Сефевидской Персией велись длительные захватнические войны, во время которых снова были разорены Армения и сопредельные страны.
Особенно большие разрушения причинили османские войска. Турецкий историк Ибрагим Печеви, участвовавший во многих военных действиях, с гордостью описал варварства османов в Восточной части Армении и сопределеьных странах. Так, рассказывая о том, что в 1553 г. турецкие войска вошли в Шорагял (Ширак), Печеви отмечал, что турецкая армия «разрушила и опустошила селения, уничтожила и сравняла с землей строения». В Ереване «сады и виноградники были преданы огню, сравнялись с землей… На 27-ой день войска достигли Нахиджеванской равнины.
В страхе перед победоносной армией города и села, дома и населенные места настолько обезлюдели, разрушились и превратились в обиталище сов и ворон, что очевидца охватывал ужас… Все села и поселки, находящиеся на расстоянии 4-5 дневного пути, поля и строения были настолько разрушены, что не осталось и следов жизни». В 1555 г. между противниками был заключен мир. Западная часть Армения перешла под власть Турции, а Восточная -Персии. Однако мир длился недолго. В 1578 г. османское войско вновь вторглось на территорию Персии и завоевало большую его часть.
Новый персидский правитель Шах Аббас, вступивший на престол в 1587 г., будучи не в силах сопротивляться могущественному врагу, в 1590 г. заключил мир, по которому Армения, Атропатена и Грузия отходили к Турции. Персидский шах, однако, решил выиграть время, реорганизовать и усилить армию и в подходящее время начать новую войну. В 1603 г., воспользовавшись беспорядками в Турции, он двинулся на турок, и завладел Атропатеной и значительной частью Армении.
Турецкий султан отправил против Персии большую армию. Избегая сражения с превосходящими силами врага, Шах-Аббас решил отступить, разрушая и опустошая на пути ряд областей, чтобы наступающие турки-османы оказались без продовольствия и пристанища. По приказу шаха в 1604 г. были разрушены многие села и города Армении, а их жители насильно переселены во внутренние провинции Персии. Угоняемое население понесло много жертв, в особенности при переправе через реку Аракс.
Мечом и нагайкой в реку были загнаны десятки тысяч людей, многие из которых, главным образом женщины, дети, старики, погибли в водах Аракса. Те, которым удалось переправиться через реку, еще долго терпели тяжелые лишения. Вместе с другими городами был разорен и уничтожен крупный торговый центр Джуга на берегу Аракса, а его жители переселены в окрестности столицы Персии Исфахана, где они, основали город Нор (Новая) Джуга.
Военные действия между Турцией и Персией возобновились в 1616 г. и с некоторыми перерывами тянулись до конца, 30-х гг. Хотя в ходе войны турецкие войска снова овладевают Ереваном, однако вскоре они терпят здесь тяжелое поражение. Вместе с персидскими войсками против османских захватчиков героически борется армянское население Еревана и Араратской долины. В 1639 г. между обоими государствами заключается мирный договор, по которому Западная часть Армении вновь отходит к Турции, а Восточная к Персии. На протяжении долгого времени это положение не претерпело существенных изменений и в основном сохранилось до начала XIX века.
Западная часть Армении в соответствии с административным устройством Османской империи была разделена на эйалеты (пашалыки)-Эрзерумский, Карсский, Себастийский, Ванский и Диарбехирский. В Восточной части Армении и Атропатене были созданы ханства-Ереванское, Нахиджеванское, Карабахское, Ширванское и др. Во главе этих административных единиц стояли паши (в Турции) и ханы (в Персии). Они назначались султаном, шахом и имели неограниченную» власть.
Попав под иго турецкой и персидской военно-феодальных; деспотий, армянские народные массы подвергались как жестокому национально-религиозному гнету и притеснениям, так. и тяжелой социально-классовой эксплуатации. Крестьяне отрабатывали кор и бегар (барщину), платили многочисленные тяжелые налоги и подати чужеземным и местным угнетателям. Плодородные земли все больше концентрировались. в руках феодалов-землевладельцев, число неимущих увеличивалось.
Следствием социального гнета были народные выступления против церкви, монастырей и землевладельцев-помещиков. К их числу принадлежит, в частности, движение в начале XVII века, возглавлявшееся монахом Мехлу. Этот монах-бунтарь призывал крестьян восстать и прекратить уплату налогов, разоблачал паразитизм духовенства, проповедовал имущественное равенство и т. п. Проповеди Мехлу, направленные против социальной несправедливости, нашли широкий отклик среди армянских крестьян.
Не угасало и пламя освободительной борьбы Армянские патриоты, будучи не в состоянии своими силами бороться с чужеземными захватчиками, посылали петиции римскому папе и европейским государствам, надеясь с их помощью освободить страну от ига ханов и пашей. Так, по решению состоявшегося в 1547 г. тайного совещания в Эчмиадзине католикос Степанос Салмастеци отправился в Рим.
В 1562 г. в городе Себастии (Западная Армения) состоялось новое совещание, после которого в Европу было отправлено специальное посольство во главе с Абгаром Евдокаци (Тохатеци). В 1672 г. в Париж прибыл купец из армянского города Битлиса (Западная Армения) Ходжа Мурад и подал письменное заявление королю Людовику XIV. Но эти обращения не дали должного результата.
С XVII века с просьбами о помощи армяне обращались к усилившемуся русскому государству. Деятели армянского освободительного движения склонялись к северу, в сторону России, связывая с ней свои надежды. Так поступили грузины еще в XVI веке.
